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コンテンツは Iain Bethune and Iain Bethune (ibethune@exseed.ed.ac.uk) によって提供されます。エピソード、グラフィック、ポッドキャストの説明を含むすべてのポッドキャスト コンテンツは、Iain Bethune and Iain Bethune (ibethune@exseed.ed.ac.uk) またはそのポッドキャスト プラットフォーム パートナーによって直接アップロードされ、提供されます。誰かがあなたの著作物をあなたの許可なく使用していると思われる場合は、ここで概説されているプロセスに従うことができますhttps://ja.player.fm/legal。
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Adventures in the Biology trade : Bioinformatics in the Petabyte era (60 mins, ~42 MB)
Manage episode 205984210 series 2307601
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Bioinformatics and more widely Computational Biology is a largely data-driven Science. The array of high-throughput technology platforms in the last 10 years mean that the amount of data being generated in this field is likely to enter into Exabytes by 2020. The challenges associated with this are quite different from the data sets generated by High Energy Physics or Astrophysics in that they tend to gathered from a wide variety of different providers. Meta-analyses of these data sets can give startling new insights but come with many caveats - in particular that the quality of the data from each provider can be highly variable. I will spend some time talking about one set of experiences I have dealing with one specific technology platform and in particular how it is clear that the detection of bias in data sets is a key element of any high-throughput analysis. This talk was given as part of our MSc in HPC's 'HPC Ecosystem' course.
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Bioinformatics and more widely Computational Biology is a largely data-driven Science. The array of high-throughput technology platforms in the last 10 years mean that the amount of data being generated in this field is likely to enter into Exabytes by 2020. The challenges associated with this are quite different from the data sets generated by High Energy Physics or Astrophysics in that they tend to gathered from a wide variety of different providers. Meta-analyses of these data sets can give startling new insights but come with many caveats - in particular that the quality of the data from each provider can be highly variable. I will spend some time talking about one set of experiences I have dealing with one specific technology platform and in particular how it is clear that the detection of bias in data sets is a key element of any high-throughput analysis. This talk was given as part of our MSc in HPC's 'HPC Ecosystem' course.
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