生物学 公開
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dessanをゲストに迎え、CRISPRの仕組みを利用した様々な技術や遺伝子回路、これからの発展について話しました。 Show notes The Nobel Prize in Chemistry 2020…The Nobel Prize in Chemistry 2020 was awarded jointly to Emmanuelle Charpentier and Jennifer A. Doudna “for the development of a method for genome editing.” Scientifc Background on the Nobel Prize in Chemistry 2020 A TOOL FOR GENOME EDITING…ノーベル財…
 
dessanをゲストに迎え、CRISPR–Cas9やTALENなどのゲノム編集技術とその背後にある遺伝学について話しました。 Show notes The Nobel Prize in Chemistry 2020…The Nobel Prize in Chemistry 2020 was awarded jointly to Emmanuelle Charpentier and Jennifer A. Doudna “for the development of a method for genome editing.” Scientifc Background on the Nobel Prize in Chemistry 2020 A TOOL FOR GENOME EDITING…ノ…
 
「この分野は専門外なのですが」、「この分野は初心者なのですが」等から始まる研究者のはなし方について思うことを言い合いました。 Show notes Researchat.fm @Amazon music … Researchat.fmがamazon musicで聴くことができるようになりました。ご登録よろしくお願いします。 料理のステップと人気度に関するツイート … @kenkawakenkenke さんのツイートを引用させていただきました。これを実験に置き換えたら結構良さそう コーヒーの科学 Pokemon GOとガチ勢の定義 ポトフさん … 日本ポッドキャスト産みの親の一人。日本のポッドファーザー。実はTwitterも日本人では十数人目に始めたらしい。たくさんのポッドキャスト番組をやって…
 
ナノレベルの分子構造をDNAシーケンシングから再構成する「DNA Nanoscope」と呼ばれる技術について、原著論文と分野の周辺を紹介しました。 Show notes A DNA nanoscope that identifies and precisely localizes over a hundred unique molecular features with nanometer accuracy. (BioRxiv 2020)…今回Sohが紹介する論文はこれ。 研エンの仲…“研究者とエンジニアのカップルが、様々な話題について時にゆるく時に白熱した議論をするPodcast” 論理回路 (Wikipedia) Peng Yen Toehold switch (Wyss Institu…
 
染色体分配時におけるKi-67の機能性に関する論文を紹介しました。 Show notes 周期ゼミ Periodical cicadas … 全米における周期ゼミの分布について 論文の縦読み … 同じオーサーの論文を時間軸で読む、論文の縦読みについてはresearchat.fmのep57にて説明しました。 Cuylen-Haering et al., Nature (2020) … “Chromosome clustering by Ki-67 excludes cytoplasm during nuclear assembly” Gerlich et al. Cell (2003) … “Global Chromosome Positions Are Transmitted through…
 
NEB社の巨大な製品カタログの楽しみ方、多様な制限酵素の世界とその巧妙な仕組みについて話しました。 第123回 ポッドキャストで語るサイエンスとその魅力(実験医学) NEB…日本語のNEBウェブサイト。NEBはNew England BioLabsの略でした(BioScienceではありませんでした。)大変申し訳ございませんでした。 NEB Literature Portal…カタログのまとめページ。 NEB Catalog & Technical Reference…これがNEBが誇る400ページ超のカタログ! Eric Lander (Wikipedia) DNA Structure and Classic experiments (Youtube)…Eric Landerの超おすすめな…
 
ENCODEプロジェクトにおけるサイレンサー探索の論文紹介と現代生物学の複雑性と多様性について話しました。 Shownotes ENCODE…ENCODEとはEncyclopedia of DNA Elementsの略! ENCODE (Wikipedia) ヒトゲノムの機能解明に向けたENCODEの試み (pdf) Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature 2001…ヒトゲノム解読の論文。 The Sequence of the Human Genome. Science 2001…ヒトゲノム解読の論文。 ENCODE 4…ENCODEのPhase 4についてはここにaimなどが書いてある。 ENCODE3勉強会…
 
現存する伝説の武器について話しました。 Shownotes 前回の武器回 researchat.fm ep30 Battle Aura 草薙剣 … 別名天叢雲剣 三種の神器 … 八咫鏡、草薙剣、八尺瓊勾玉。三種の神器といえばKOFを思い出しますね。 一向一揆 THE CELL … 分子生物学における代表的な鈍器の一つ 放射性炭素年代測定 … C14の存在比率で年代測定をする手法 空海 熱田神宮 … 草薙剣の実物が祀られている 三種の神器と贈与税 … 非課税 壇ノ浦の戦い … 草薙剣の形代が一度失われた 聖骸布 古事記 千と千尋の神隠し ポールアレン 十握剣 … 日本神話に出てくる剣。特定の剣を指す言葉ではなく、10束の長さの剣の総称。 天之尾羽張剣 … イザナギが使用した十握剣。カグツチを斬…
 
kyonさんをゲストに迎え、実験道具のこだわりと誤差、おすすめの餃子、無水料理や料理の楽しみなどについて話しました。 Shownotes ピペットマン 知らないの?とバカにされないための正しいピペッティング操作とテクニック … フォワード法だけではなくリバース法も使っていこうぜ! Gilson Eppendolf レイニン Liquidator 96 Gilson プレートマスター Oリング ピペットチップ LoBindチューブ パラフィルムの上でやる パラフィルムの上でやる2 … Hiroko Bannai先生のツイートを引用させていただきました。 自家蛍光 96穴ガラスプレート MatTek IWAKI Matsunami ピンセットを研ぐ 鍛冶師・憑二斉 … ブラックジャックの研ぎ師 …
 
kyonさんをゲストに迎え、自作のモノクローナル抗体をつくるプロトコルとその魅力について教えてもらいました。 Shownotes 抗体 (antibody)…免疫グロブリンの総称。参考ページ:抗体とは (MBLのwebページ)、抗体とは? (中外製薬webページ) 抗体ガイド 4. ポリクローナル抗体とモノクローナル抗体 (abcamのwebページ) モノクローナル抗体の作り方 (中外製薬webページ) 重鎖・短鎖…抗体を構成する部位。参考ページ: Sigmaのwebページ エピトープ…抗体の抗原認識部位 免疫染色…抗体を用いて目的のタンパク質のみを染めることで可視化する手法。最も一般的なのは蛍光でラベルする蛍光免疫染色 (Immunofluorescence staining) ELISA…
 
kyonさんをゲストに迎え、自粛期間中の実験動物の飼育、コーヒーの楽しみ方、ツーリングや海底トンネル工事の魅力などについて好き勝手に話しました。 Shownotes ゲストのKyonちゃんが最初に登場したのは、エピソード14とエピソード15でした。PIWI-piRNAについては、ep14にてお話ししています。 ハムスター (Wikipedia)…kyonは研究にゴールデンハムスターを使っている クローズドコロニー…個体間の遺伝的な性質にばらつきを残しつつ、集団としては特定の遺伝的形質を示すように維持されている系統のこと。 近交系…個体間の遺伝的差異をできるだけ少なくなるように維持された系統。実験動物(マウス)は基本的に近交系 ショウジョウバエの植え継ぎ…ジエチルエーテルで麻酔をかけたあとに新…
 
アイデアとノートの取り方、ノートの変遷、Zettelkasten (ノート作成方法)について話しました。 Shownotes MOLESKIN … みんな大好きなMOLESKINのノート MOLESKIN クラシック ハード 方眼 ラージ (Amazon) … これの色違いを使っています。もらい物ですが…ただ万年筆との相性は悪い。(tadasu) 宮崎駿さんとMOLESKIN (Twitter) … @machizo3000 さんのツイートを引用させていただきました。 石井裕 (Wikipedia) … Twitter @ishii_mit Hideshi Hamaguchi (Wikipedia) … Twitter @hideshione Rollbahnのノート (Amazon) … …
 
バイオテクノロジーと枯れた技術の水平思考、ピタゴラスイッチ、507 Mechanical Movementsについて話しました。 Shownotes 任天堂 (公式サイト) … 任天堂 横井軍平 (Wikipedia) 宮本茂 (Wikipedia) 岩田聡 (Wikipedia) 桜井政博 (Wikipedia) 田尻智 (Wikipedia) 横井軍平ゲーム館 (Amazon) … 横井軍平さんが作ったおもちゃとゲームに対する考えを一通り学ぶことができる。 山内溥 (Wikipedia) … 3代目任天堂社長 ゲーム&ウォッチ (Wikipedia) ウルトラハンド (Wikipedia) ラブテスター (Wikipedia) 枯れた技術の水平思考 … 今回のエピソードでは、枯れた技術に…
 
エンタメの旬、オンライン指導、おすすめの漫画紹介(大盛)、受動的・能動的情報摂取、ポッドキャストのプレイリストについて話しました。 Shownotes バーチャファイター2 (Wikipedia) ストリートファイターII (Wikipedia) 梅原大吾 (Wikipedia) FPS (Wikipedia) VALORANT ゲームブック (Wikipedia) 円城塔 (Wikipedia) にゃんたんのゲームブック TRPG (Wikipedia) 遊☆戯☆王 (Amazon) Street Fighter V (Amazon) 鉄拳7 (Amazon) Mortal Combat 11 (Amazon) グラブルファンタジーヴァーサス (Amazon) Twitch Mildom …
 
改良型のCRISPR–Cas9によるゲノム編集ツールAFIDと変異パターンの予測について原著論文を紹介しました。 Shownotes Precise, predictable multi-nucleotide deletions in rice and wheat using APOBEC–Cas9, Nature Biotechnology 2020…今回はこの論文を紹介しました。APOBEC–Cas9 fusion-induced deletion systems (AFIDs)と呼ばれるゲノム編集技術です。 Non-homologous end joining (NMEJ)…Cas9で誘導される二本鎖DNA切断が修復される仕組みの一つ。 Researchat.fmで話した過去のCas9…
 
英単語の不規則な複数形とグラフィティについて話しました。 Shownotes Joe Rogan … マッチョな徹子の部屋、ことJoe Roganのポッドキャスト タコが鷲を食べようとしている動画 … 鷹ではなく鷲でした 単複同形 … 単複両形ではなく単複同形です。恥ずかしい。 ラテン語起源の変化、ギリシャ語起源の変化 us -> i … nucleus -> nuclei, radius -> radii, stimulus -> stimuli, focus -> foci, fungas -> fungi, alumnus -> alumni, syllabus -> syllabi a -> ae … alga -> algae, larva -> larvae um -> a … …
 
バターコーヒーの自作、ゲーム実況の面白さと視聴コンテンツを探す労力問題、おすすめのYoutubeやアニメについて話しました。 Shownotes Bullet Proof Coffee (バターコーヒー, 完全無欠コーヒー) シリコンバレー式 自分を変える最強の食事…この本がバターコーヒーの元ネタ。一時期話題になっていた。バターコーヒーでは痩せない(tadasu談 n=1) tadasuのバターコーヒーの作り方: コーヒー:250-500ml + グラスフェド無塩バター:15g + MCT oil: 15ml -> ミキサーでドン!!! グラスフェド無塩バター…日本は無塩バターが高いな…さすがに…しかもこれがいいのかはわかりません… MCTオイル (Amazon)…これも日本だと高いですね……
 
動物の体外で培養された細胞により作られた培養肉、さらに植物性の代替肉や代替卵について話しました。 Shownotes Choudhury et al., Trends in Biotechnology (2020) … 最新のCultured meat(培養肉)界隈について How it’s made: Cultivated Meat … 上記論文を書いた著者のblog。Cultured meatについての全ての情報が書かれている。必読。 Sayamaさん(@Sayamabio)のtweet … いつも素晴らしいBiotechnology関連の情報をくださるsayamaさんのツイッターで上記の論文とblogの情報を知りました。ありがとうございます。 Cultured Meat Company…
 
RNA分子の空間的な近接性を計測するRIC-seqという手法について、原著論文を紹介しました。 Shownotes RIC-seq for global in situ profiling of RNA–RNA spatial interactions. Nature 2020…今回紹介したRIC-seqの原著論文へのリンク。 核酸の二次構造 (Wikipedia) RNA結合タンパク質 MBLライフサイエンス ノンコーディングRNA動態解明の最前線 (pdf) Micrococcal Nuclease, NMase (NEB) Ep16, Researchat.fm…エピソード16では分子の近接性から空間構造を再構成するさまざまな方法について解説しています。 Comprehensive M…
 
第二回異世界分子生物学会の周辺について話しました。 Show notes 第2回異世界分子生物学会(本) … 感想は #異世界分子生物学会 でよろしくお願いします。 第2回異世界分子生物学会(電子) 第1回異世界分子生物学会(本) 第1回異世界分子生物学会(電子) 日本分子生物学会 怪獣生物学入門 … 理研 倉谷滋先生が描く、怪獣デザインとは何か。SF作品に登場する架空の生物のリアリティーについて第一線の発生生物学者が解説する。これこそ異世界発生生物学会といえる。 researchat.fm ep38 … dessanといろいろ語った回。dessanが異世界分子生物学会に投稿した作品についてはこのエピソードで話されています。 思弁的実在論 Christian de Duve 進化の特異事象 …
 
科学論文の探し方、読み方とその楽しみ、そして理想の論文について三人で熱っぽく話しました。 Shownotes Nature Review Cancer…Natureが出版しているレビュー誌の一つで、がん研究に関連する論文を取り扱う。 Nature Review Genetics…Natureが出版しているレビュー誌の一つ、遺伝学に関連する論文を取り扱う。 Boston Chromatin Club Blog Karl Deisseroth (Wikipedia)…光遺伝学の開祖 DNA microscopy, researchat.fm…これについては、エピソード16で解説しています。 物体にデータをエンコードできる「モノのDNA」の時代が、小さなウサギのフィギュアから始まった (WIRED…
 
クモについて詳しいゲストを迎え、フリーハンドで丸と直線を描くトレーニング、メールで進むかまいたちの夜、自作PC、論文管理の難しさ、趣味としてのポッドキャスト、コーディング環境とWet/Dryのデータ管理について話しました。 Show notes Readable Lab NotebookのTipsを集めたいので、ご協力いただける方はtwitterにつぶやいていただくか(我々が検索可能な形であればうれしいです)、お便りコーナーから連絡いただけると助かります。そのうちまた紹介したいと思います。 幻影旅団 HUNTER×HUNTER (Amazon) フリーハンドで丸と直線を書く…デザイナーの山中俊治さんによると、「今でもスケッチを描く前には、初心に返って、一枚の紙を楕円で埋めつくすことから始めま…
 
クモに詳しいゲストをお呼びして、クモについて話しました。 Show notes Albert-László Barabási … scale-free networkで知られるネットワーク科学研究者 Uri Alon … システム生物学の研究者。 Uri Alonによるシステム生物学の授業 (YouTube) … 以前から更新されているUri Alonによるシステム生物学の授業。授業の中でリラックスのために深呼吸を促すこともある。 システム生物学入門 (Amazon) … Uri Alonによるシステム生物学に関する入門教科書。 ネットワーク科学: ひと・もの・ことの関係性をデータから解き明かす新しいアプローチ (Amazon) … Barabásiらによるネットワーク科学の教科書 クラスタ…
 
RNA分子の局在を一斉に捉えるイメージング技術とそれをささえる巧妙な方法について原著論文を解説しました。 Show notes elmo囲い 電王戦 Single-cell in situ RNA profiling by sequential hybridization. Lubeck et al Nature Methods 2014…CaiらによるSeqFISHのオリジナル論文。無料で読めます。 Ep16. Beyond imaging (Researchat.fm)…エピソード16回ではイメージングせずに位置情報を再構成するDNA Microscopyについて解説しています。 WHAT IS SEQFISH?…CaiらによるSeqFISH技術紹介のページ。とてもわかり易いです。 Sp…
 
仕事タスクを最適化できない問題、ロードマップと攻略、門戸の広げ方、教科書の読み方とウェブ授業、DeepLの使用感について話しました。 Show notes 梅原大吾 ゲームパッド ファイティングエッジ刃 … プロゲーマーsakoさんが開発に関わり、大会でも使用しているアーケードコントローラー。最近coelaも買いました。 Hit Box … ボタンしかないアーケードコントローラー(レバー操作もボタンで行う)。プロゲーマーの梅原大吾選手も大会で使用している。 vim … テキストエディタ emacs … テキストエディタ Yeti Blue … researchatメンバーが収録につかっているマイク WEB DEVELOPER ROADMAP 2020 … Webデベロッパに必要な知識・技術の…
 
ゲストにkotoneさんを招き、ディープラーニング、機械学習とそのアルゴリズムや計算用マシンについて話しました。 Show notes 機械学習 (Wikipedia) ディープラーニング(深層学習) (Wikipedia) ニューラルネットワーク (Wikipedia) パーセプトロン (Wikipedia) GPU (Wikipedia) ディープラーニング入門 Chainer チュートリアル 株式会社 Preferred Networks Chainer NVIDIA CUDA-X GPU-Accelerated Libraries for AI and HPC Preferred Networks、1024個のGPUでディープラーニングの世界最高速を実現と発表 NARUTO -ナルト…
 
PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)の原理について基礎から話しました。dessanをゲストに迎えました。 Show notes PCR(ポリメラーゼ連鎖反応) … 特定のDNAサンプルから目的のDNA配列を増幅させる方法。分子生物学における最も基本的な実験の一つ。 DNA(デオキシリボ核酸) … 地球上の生命体の遺伝情報を司る高分子化学物質。いわゆるDNA。 水素結合 … 水素間で起きる非共有結合性の相互作用。2本のDNA鎖が反平行に配向し二重らせん構造を形成する際、A-T,G-Cの間は水素結合によって結ばれる。A-Tは2個、G-Cは3個の水素結合によって結ばれるため、結合の強度が異なる。共有結合やイオン結合と比べて弱く、ファンデルワールス力よりは強い。 DNAポリメラーゼ … DNAを複製するた…
 
記念すべき第50回は、酵母のストレス環境におけるタンパク質の翻訳制御に関する原著論文を紹介しました。 Show notes Cells alter their tRNA abundance to selectively regulate protein synthesis during stress conditions. Torrent et al., Science Signaling (2018)…今回のエピソードで紹介した論文。フリーのオンラインアクセスがあります。 コドン (Wikipedia) … コドンについてはep7とep37(入門編)でも話しています! tRNA (Wikipedia) RT-qPCR (Wikipedia) … 本論文でtRNAの定量に使われた手法。 グル…
 
「わたしは人類」と「柿ゲノム」の共通項を無理やり探しました。 Show notes 死がふたりを分かつまで やくしまるえつこ わたしは人類 (YouTube) やくしまるえつこさんによる「わたしは人類」の解説 … やくしまるえつこさんによるわたしは人類の解説。ぜひ読んでいただきたい。 やくしまるえつこさんによる「わたしは人類(I’m Humanity)」の解説 … シアノバクテリアと塩基の情報があります。 Ohno and Ohno. Immunogenetics (1986) … 大野夫妻によるDNA music論文のオリジナル Susumu Ohno, DNA Music (YouTube) 空間知覚拡張のための“聞こえる化”デバイスの開発 … 未踏2015にて発表された「聞こえる化」の…
 
レベルEのサキ王女編からスタートし、アメフラシ、ボネリムシ 、半倍数性、ヴォルバキアによる破壊、ゾウリムシ、カモノハシ、オスの三毛猫など、真核生物における多様な性決定システムと性染色体について話しました。 Show notes レベルE … 冨樫義博先生の怪作。生物SF満載。マクバク族サキ王女編について言及。 SRY(sex-determining region Y) … 一部の哺乳類において性決定に重要な遺伝子。 Koopman et al. Nature (1991) … SRYをメスのマウスのembryoにおいて発現させてオス化させた論文。 heterogamety …異型配偶子性。XYやZWのような性染色体がヘテロな状態の配偶子をさす。 homogamety … 同型配偶子性。XXや…
 
新型コロナウィルスの広がりで注目を集めているCas13を用いた簡便かつ高感度な核酸検出法、SHERLOCKという技術について原著論文を紹介しました。 Show notes Specific High-sensitivity Enzymatic Reporter unLOCKing…これがSHERLOCKの略! Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2. Science 2017.…SHERLOCKのオリジナル論文。Cas13のもつ無差別なRNA分解活性 (collateral activity)と蛍光プローブを利用することで、ウィルスなど様々な核酸分子の検出を簡便に行う技術の扉を開いた。無料で論文の全文が読めます。 Multiplexed …
 
昔はPCRオイルというものがあったらしいというお便りから、自作試薬やプロトコル、培養細胞と人権、おすすめ映画について話しました。 Show notes PCR増幅法 (Wikipedia) サーマルサイクラー概要—歴史と発展 … ThermoFisherのPCR概要。オイル、加熱蓋(head lid)について言及あり。 Researchat.fm episode 24…PCRの発明者、Karry Mullisを追悼して、初期プロトコルからPCRを用いた特殊実験について話しています。興味があればぜひ。 Gel purification…切り出したゲルをフィルターペーパーの上に乗せて遠心するとDNA抽出できるらしい… Gibson Assembly Qiagen Buffers…Quiagenの…
 
ワンボタンラブ、親指シフト、煽り文化、鬼瓦とシルクロード、バトル・ロワイアルのオレ設定、江戸時代の厨二病、ATGC殺人事件、イルカとセンジュナマコ、キリンと染色体、Web漫画カレンダー、学会の質疑応答について話しました。 Show notes ワンボタン河野太郎 親指シフト Kinesis Keyboard T-Code 第二回おじリーグ BLAST ビーフ 公開処刑 鬼瓦 火の鳥鳳凰編 ゴルゴネイオン ゴルゴーン … ステンノー、エウリュアレー、メドゥーサのゴルゴン三姉妹。 パルミラ 鬼師 … 医師、弁護士、鬼師 バトル・ロワイアル 中二病と厨二病 へうげもの 森博嗣 Vシリーズ … 森博嗣のミステリーシリーズ。[Kindle] エルキュール・ポワロ … 言わずとしれた名探偵。オリエント急…
 
1800年代後半、Natureに投稿した日本人研究者(杉浦重剛、小藤文次郎、関谷清景、伊藤篤太郎、南方熊楠)について話しました。 Show notes Nature: Aphorisms by Goethe. Huxley, Nature (1869) … 1869/11/04に出版された記念するべきNature第1号の最初の記事(論文)。Thomas Huxleyがゲーテの言葉をドイツ語から英語に訳した。”Nature! We are surrounded and embraced by her—unable to step out of her and unable to penetrate her more deeply.”から始まる。この言葉が本当にゲーテのものだったかについては議論…
 
新型コロナウィルスに関連する論文の盛り上がり、生物学を支えるデータベースの信頼性、無限の可能性があるキーボード、早食いの攻略について話しました。 Show notes Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag…解析方法におおくの疑義が短時間で投げかけられ、収録の翌日、この論文はbioRxiv上で撤回された。元のリンクから100件近いコメントが見れる。https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1#disqus_thread 自作TRRSケーブルキット…遊舎工房さんの店舗で購入 無限の…
 
システム漫才、フードファイトの攻略、今期のアニメと映画、作家の思考について話しました。 Show notes ミルクボーイ … M-1 2019覇者、ミルクボーイの公式YouTubeチャンネル。おすすめはSasuke、デカビタ、滋賀、あやとり、湯葉 PCRの歌 … すみません収録時にメーカーを間違えて発言していました。 PCRの歌の歌詞 梅原大吾・MAX鈴木 … MAX鈴木とは。梅原さんとMAX鈴木さんの対談。途中、大食いの攻略についてのコメントあり。 ネイサンズホットドッグ …. ネイサンズホットドッグの早食い選手権。アメリカの独立記念日に毎年行われる。速さと量が必要となる。 Usain Bolt is No Takeru Kobayashi … 小林尊がなぜすごいのかという評論。 Dis…
 
出芽酵母の染色体をゲノム工学の技術によって1本に連結させた論文とその周辺について話しました。 Show notes Creating a functional single- chromosome yeast … n=16の染色体を持つ出芽酵母において、テロメアとセントロメアを除きながら染色体同士を結合させ、最終的に大きな1つの染色体にした論文。 A single circular chromosome yeast … 1本にした論文において、さらにテロメアを除いて結合させることにより巨大な環状染色体にした論文。 FISH analysis of the telomere sequences of bulldog ants (Myrmecia: Formicidae) … 当時遺伝研で研究さ…
 
2019年よかった本とマンガ、映画やドラマについて紹介し、2020年の展望について3人で話しました。 Show notes RTA … Real Time Attack. 同一ゲームの攻略速度を競う。 GDQ (Games Done Quick) … RTAを行う大きなイベント Pokémon Red race in 1:54:28 - SGDQ 2016…ポケモン赤バージョンのバグなしタイムアタック。ニドキング無双が見られる。KEIZARON選手の魅せプレイがすごい。 Donkey Kong Country 2 by V0oid in 1:32:51 - Awesome Games Done Quick 2016 … ドンキーコング2の102%最速攻略を目指す。 Kirby Super S…
 
2019年の収録したエピソードを振り返りつつ、今年3人が買ってよかったものについて話しました。 Show notes 2019年買ってよかったものまとめ (researchat.fm) Optical Pooled Screens in Human Cells. Feldman et al Cell (2019)…CRISPR-Cas9による遺伝学スクリーニングの結果を光学系イメージング (In situ sequencing)により細胞に与えられた摂動と破壊された遺伝子の情報を読み出す技術。 Yeti Blue…Researchat.fmで3人とも使っている性能のよいUSBマイク。様々な指向性の切り替えなども簡単。 iPad Pro…coelaアンドsoh絶賛のiPadProとApple …
 
dessanをゲストに迎え、小島秀夫監督、異世界分子生物学会、零號琴、奇書、研究者の固有性と作家性について話しました。 Show notes 小島秀夫 DEATH STRANDING 勝つために戦え!…押井守監督の勝負哲学が収められた一冊。研究者も共感する部分が多いと思います。 異世界分子生物学会 飛浩隆 零號琴 J.J. Abrams Ship of Theseus…J.J. Abrams監修の奇書 Memories(ギー・ドゥボール)…“紙やすりの表紙で装丁されており、隣り合わせになった他の書籍を破壊 するようにできている。”(Wikipedia, ギー・ドゥボールのページより引用) 生者と死者―酩探偵ヨギガンジーの透視術(泡坂妻夫)…“はじめに袋とじのまま、短編小説の「消える短編小説」…
 
dessanをゲストに迎え、分子細胞生物学の入門知識について話しました。 Show notes ロバート・フック Micrographia アント二・ファン・レーウェンフック レーウェンフックとフェルメール 細胞説 自然発生説 前成説 後成説(エピジェネシス) 真核生物 原核生物 エピジェネティクス DNA RNA タンパク質 遺伝子 ゲノム 染色体 体細胞分裂 凝集した染色体が娘細胞に分配される … 真核生物においては、DNAを二個の娘細胞に分配するために染色体とよばれる凝集した構造が現れる。姉妹染色体が娘細胞に均等に分配される。本当にこの現象は美しく生命的神秘にあふれている。最後には核の形成と染色体の脱凝集の様子が映されている。どのように姉妹染色体が絡まらずに別れることができるのか、凝集…
 
DNAをシリカビーズに封入し、3Dプリント可能な材料に混ぜることで、DNA入り3DオブジェクトをプリントするDNA-of-things (DoT)の技術と、DNA Storageと噴水符号化の技術について紹介しました。 Show notes A DNA-of-things storage architecture to create materials with embedded memory. Koch et al., Nature Biotech (2019) … DNA-of-thingsのオリジナル論文。スタンフォードバニーちゃんの情報をDNAとして記録し、シリカビーズに入れて3Dプリンティング可能な材料に混ぜ込み、3Dオブジェクトを3Dプリンタによって作成するDNA-of-thin…
 
RNAポリメラーゼを固定したES細胞や組織切片上で作用させ、DNAバーコードを位置情報と共に読み出すZombieという技術を紹介しました。 Show notes 俺の通勤電車にCellを読んでる女子が乗ってくるんだが (カクヨム) In situ readout of DNA barcodes and single base edits facilitated by in vitro transcription, Askary et al., Nature Biotechnol 2019…今回、Sohが紹介した論文。Elowitz labより。 Zombieは、‘Zombie is Optical Measurement of Barcodes by In situ Expression’……
 
鉄拳 TWT Finals 2019の結果とコミュニティーの重要性について話しました。 Show notes Tekken World Tour 2019 TWT2019の主要大会結果一覧(格ゲーチェッカー) … 格ゲーチェッカーさんがまとめたTWT2019の結果一覧。パキスタンの国旗が目立つが、様々な国旗が現れているのがわかる。 TWTのスケジュール … 今年からDojoというコミュニティー主体の大会が追加された。 朝日新聞乗京記者によるパキスタン鉄拳事情に関する記事 … EVO Japan 2019を制したArslan Ashを取り巻くパキスタン鉄拳事情についての取材記事。とりあえず内容が濃い。 Arslan Ash … パキスタンから突如現れたニュースター。今年の鉄拳界の主役であること…
 
最近新作映画が公開されたガンダムと新刊が発売されたファイブスター物語について話しました。 Show notes ガンダム エヴァンゲリオン ガンダムGのレコンギスタ キュベレイ(Wikipedia) ファンネル(Wikipedia) ファイブスター物語(Wikipedia) ファイブスター物語(公式) ゴティックメード(Wikipedia) GTMカイゼリン … イージーアッセンブル・スーパークオリティモデル「カイゼリン」は年末発送予定です! ∀ガンダム(Wikipedia) … おヒゲのガンダム。現在ネット用語で良く使われている「黒歴史」の言葉の元ネタでもある。 シド・ミード カブトムシの角は蛹で突然出現できるのか 近藤滋先生のブログ … めちゃくちゃおもしろい。 Beetle horns…
 
訪れたことのある国々、行ってみたい国や場所、旅行の楽しさ、最近観たNetflix番組について話しました。 Show notes アーサー王 アーサー王の墓 (アヴァロン) Fate/Grand Order…アーサー・ペンドラゴン(プロトタイプ)が来てくれました。 メイン州のウニ工場 ガラパゴス諸島ツアー キト-ガラパゴス ダーウィン 種の起源 クノッソスの迷宮 クレタ島 クレタ島にある生物研究所 モーターサイクルダイアリーズ…チェ・ゲバラが南米をバイクで旅をした名映画。[Amazon Video] 大英博物館 テート・モダン…ロンドンにある近代美術館。 旅する木 星野道夫…sohとtadasuおすすめのエッセイ。オーロラを見たくなる。 星野道夫 Final Fantasy XV…ファイナルフ…
 
CRISPR-Cas9を用いた全く新しいゲノム編集技術Prime editing (PE)についての原著論文を紹介しました。 Show notes Search-and-replace genome editing without double-strand breaks or donor DNA. Anzalone et al., 2019, Nature…今回とりあげたPrime editing論文の原稿。 Functional Genetic Variants Revealed by Massively Parallel Precise Genome Editing. Shalon et al., 2018, Cell…In vivoでgRNAにコードさせたrepiar templat…
 
漫画やゲームに登場する武器の元ネタ、現実に存在する変わった武器について話しました。 Show notes Unreal Engine…ゲームの製作エンジン。ストリートファイターV、フォートナイトなど多くのゲームがこのエンジンで作られている。 Unreal Engineを採用したゲームソフト一覧 Quartz Composer…Macの開発環境として提供されているでビジュアルプログラミング言語。 ソウルキャリバーシリーズ…バンダイナムコ開発の3D格闘ゲーム。様々な武器を持ったキャラクターが特徴。 蛇腹剣…フィクション作品にしばしば登場する、ワイヤーのような紐で繋がっている剣。めっちゃかっこいい。 ガリアンソード…上記蛇腹剣の元祖と思われる。 刀狩りの張…漫画「るろうに剣心」に登場するキャラクタ…
 
レガッタ、通し矢、剱岳と修験僧、トランスジャパンアルプスレース、ララムリ、千日回峰行、ツール・ド・空海、科挙と状元、ああ播磨灘について話しました。 Show notes レガッタ(Wikipedia) Head of the Charles Regatta…ハーバードとMITの側を流れるチャールズ川で行われるレガッタの対抗戦 ソーシャルネットワーク ウィンクルボス兄弟(Wikipedia)…ウィンクルボス兄弟はハーバード卒ながら北京オリンピックに出場。彼がレガッタ対抗戦で相手チームがFacebookを使っていたことを知ったことからソーシャルネットワーク(映画)の話は動いていく。 ロドスのレオニダス (Wikipedia)…古代オリンピック最強の選手。マイケルフェルプスが2168年ぶりに記録を…
 
三十路がフリック入力を習得するためにがんばった過程とそこから見えきた認知問題(左右盲・文字認識など)、おすすめのNetflixについて話しました。 Show notes 左右盲…色盲といった既存の言葉から派生した言葉で、医学的に定義づけされている病気ではないことに注意。右と左を瞬時に判断できない様子を指す。 フリック入力…ガラケー入力とはことなり中心、左、上、右、下の方向にあ、い、う、え、おの五個の母音が配置されている。「あ」を押しながら左にスワイプすることで「い」が入力される。スマホ時代になりユーザーが爆発的に増えた。 NewtonにおけるHanabiの特許…橋本佳幸さんによるかな入力の特許 おそらく橋本さん本人によるiPhoneフリック入力に対するコメント…正直本人かは不明です。 ニュー…
 
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